Wysokość: 20-40 cm. Liście wyrastają z licznych, cienkich cebul, skupionych na podziemnym, silnie skróconym, brunatnożółtym kłączu grubości około 4 mm, które rozrasta się poziomo pod powierzchnią gleby. Podczas wegetacji każde kłącze wytwarza 2-3 pokolenia liści, dzięki czemu szczypiorek może być zbierany niemal przez cały sezon wegetacyjny. Szczypiorek kwitnie do przełomu lipca i sierpnia, a po zapyleniu i zapłodnieniu zawiązują się owoce - torebki zawierające liczne, drobne, trójkanciaste, nieco pomarszczone, ciemnobrunatne lub czarne nasiona.