Liście grążela drobnego dorastają tylko do 15 cm, a ogonki liściowe są spłaszczone (u grążela żółtego są trójkanciaste). Kwiaty mają zielonożółte działki kielicha i średnicę około 2,5 cm, zaś owoce są około dwa razy mniejsze od grążela żółtego (kształt gruszkowaty, często u góry zagięte).
Występuje w Polsce bardzo rzadko. Czasami można się z nim spotkać na północy kraju. Gatunek, stanowiący relikt późnoglacjalny.